Evedance based Drum ‘n’ bass
Какой тест так и манит врача онколога, но ещё не вошёл в клин.реки? Как жить с постоянным чувством неудовлетворённости, когда PD-L1 не светится, а микросателлиты все стабильны?🦄
Да, да, мой дорогой EBM-щик, речь пойдёт про TMB. TMB (tumor mutational burden)- опухолевая мутационная нагрузка.🏗
TMB это общее число соматических мутаций на 1 мегабазу (мб) генома. Высокий уровень ТМВ (TMB-high) предполагает биосинтез большого количества мутантных белков, неоантигенов, и как следствие повышение противоопухолевого иммунного ответа. TMB может быть независимым предиктором ответа опухоли на терапию ингибиторами контрольных точек (ИКТ).
За последние годы появилось много исследований посвящённых ТМВ как количественному биомаркеру ответа на ИКТ при множестве солидных опухолей: НМРЛ, МРЛ, меланома, плоскоклеточный рак головы и шеи, рак уротелия. Клинические исследования, опубликованные в 2017-2018г.проспективно подтвердили роль TMB-high (>10мут/мб и >14мут/мб) в качестве биомаркера для отбора пациентов с НМРЛ для иммунотерапии.
А дальше начинается возня🙄. Золотым стандартом диагностики ТМВ считается полное секвенирование экзома (ПСЭ) ткани опухоли и образца крови, но мы то с Вами понимаем, как это дорого и долго. На деле чаще используются панели, охватывающие несколько сотен генов. В целом результаты оценки ТМВ с помощью панелей хорошо коррелируют с результатами ПСЭ, однако стандартов диагностики, в том числе для разных типов рака пока нет.
На сегодняшний день оценка ТМВ с помощью FoundationOne является единственным одобренным FDA тестом, но мы же не будем тратить тысячи $ только чтобы угодить FDA. Для себя мы выбрали панель от Qiagen, 486 генов, 1.3 мб генома, технологии уникальных молекулярных индексов (UMI) и прочие приятности, включая доступную цену.
Тем не менее, для внедрения ТМВ в широкую клиническую практику необходима стандартизация подхода. О сравнении различных подходов для оценки ТМВ и о попытках определения эталонного стандарта тестирования-читайте в нашем майском дайджесте по онкогенетике.